南京天妃宮主要有三處：一在江東門外上新河北岸，一在安德門外大勝關，這里指的是在下關儀鳳門外獅子山下的“弘仁普濟天妃之宮”，簡稱龍江天妃廟、下關天妃宮或天妃宮。據(jù)《儉陵玄觀志》記載，天妃宮依山腰而建，前至山麓，有龍江白宮前流過。宮內有正殿后殿、雨廓廊廡、三清殿、玉皇閣等建筑，宮后還植種了婆羅樹。其中，在西側廊廡中，還繪有鄭和航海途中所見到的海中靈異。宮中的玉皇閣、寶蓋珠幢，高可見江，與遠近帆檣相映。
明朝初年，因朝廷加強了與海外的聯(lián)系，遣使各國日漸頻繁。為保海上航行平安，祈求海神天妃的活動較前更為興盛。關于鄭和在出使西洋的途中，屢求天妃救助，所謂化險為夷的事也有所記載。如《皇明大政記》和《明會典》中就有“永樂五年(1407年)九月戊午，建龍江天妃廟成。命太常寺少卿朱焯祭告。太監(jiān)鄭和使古里、滿刺加諸番國還，言神多感應，故有是命”。宮廟建成之后，“每歲從正月十五日，三月二十三日，遣南京太常寺官致祭”。另據(jù)《明成祖實錄》和《湄洲嶼志略》己載，永樂七年正月，御封天妃為“護國庇民妙靈昭應弘仁普濟天妃”，并賜額此宮。永樂十四年(1416年)四月，明成祖朱棣撰寫了《御制弘仁普濟天妃宮之碑》立于宮中。
關于天妃宮的始建年代，由于文獻史料的記載互有出入，故今人亦說法各異。一說始建于永樂五年，為鄭和第一次出使西洋歸來之際；另一說以為始建于永樂十四年明成祖朱棣御書碑文之時。今據(jù)《御制弘仁普濟天妃宮之碑》考證，碑文在記敘了“建廟于都城之外，龍江之上，祀神報貺”之后，又寫到“自是以來，神益顯休應，視前有嘉……爰書其事，建碑于宮”。可見，建宮和立碑，并不在同一時間，理應建宮在前，立碑于后。永樂五年九月，正值天妃宮建成之際，鄭和第一次下西洋遠航平安歸來，明成祖朱棣在聽取了鄭和船隊在途中蒙天妃庇佑、化險為夷的經(jīng)過之后，遂即遣官到落成的天妃宮致祭以“祀神報貺”。由于天妃宮建成以后，所謂天妃靈應，屢顯不已，神之功德，視前有加，才有明成祖朱棣于永樂十四年親撰碑文，在天妃宮鐫立碑記一事。而在這之前的永樂七年，明成祖曾御賜此宮宮額，足見天妃宮早已于永樂十四年以前建成。因此，天妃宮的竣工年代，應為永樂五年九月。
《御制弘仁普濟天妃宮之碑》，又稱《天妃宮碑》，是國內現(xiàn)存最大的鄭和下西洋刻石。碑高4.63米，寬1.51米，厚0.53米。龜趺碑座，0已殘，龜趺高1.17、殘長3.10米。碑額上篆書“御制弘仁普濟天妃宮之碑”十一字。碑額上浮雕二龍，互相纏繞，龍頭各在碑額的兩側，造型生動，雕刻精美。碑文正楷，20行共708字。此碑久經(jīng)風雨剝蝕，碑身已有裂痕。少數(shù)字跡已漫漶，但大都仍清晰可辨。