劍湖位于我國西部候鳥遷徙的通道上,既是候鳥遷徙過境時的集結點和停歇地,又是遷徙水禽的越冬棲息地。不僅如此,劍湖濕地是一個物種豐富度較高,生活型較齊全,多樣性較明顯的高原淡水湖泊,僅水生維管束植物區(qū)系就有26科45屬59種,其他動物如鳥類32科62屬94種,約占云南省鳥類種數(shù)(810種)的11.6%,占全國鳥類總數(shù)約7.5%;魚類3目4科14屬15種;兩棲動物1目7科4亞科13屬13種;昆蟲10目49科117種。在眾多的物種多樣性中,有許多是云南高原濕地或當?shù)氐奶赜蟹N,諸如云南高原湖泊所特有的單子葉植物水鱉科的海菜花(Otteliaacumianta);光唇裂腹魚(Schizothoraxlissola-biatus)、云南裂腹魚(S.yunnanensis)、后背鱸鯉(Percocyprispingi-retrodorslis)和劍湖高原鰍(Triplophysajianhuensis)4種為云南特有;劍湖高原鰍是八十年代才發(fā)現(xiàn)的新種,為劍湖特有。
劍湖濕地植被有4個植被型14個群系19個群落。劍湖所在地劍川是模式標本重要產地,初步統(tǒng)計,在劍川采集的模式標本有14種(亞種、變種)隸屬13科。保護好劍湖、劍湖周圍的森林植被以及玉華水庫等濕地、水域,為候鳥提供一個安全有保障、自然環(huán)境優(yōu)越、食源豐富的理想停歇地和順利越冬的棲息環(huán)境,將對云南鳥類多樣性保護起到十分重要的作用。