孔氏南宗家廟位于衢州市區(qū)新橋街中段北側(cè)，占地面積14000平方米，建筑面積7490平方米。家廟東軸線、中軸線建於清道光年間，后經(jīng)修繕；市政府出資1600萬元于1998年11月開始復(fù)建的家廟西軸線與孔府、孔園，2000年5月竣工，2000年7月1日正式對外開放。
一、家廟主要建筑：
東軸線：正門、恩官祠、啟圣祠、圣澤樓。
中軸線：正門(孔氏南宗家廟)、大成門、東西兩廡、大成殿。
西軸線：正門(孔府先宗)、五支祠、襲封祠、六代公爵祠、思魯閣。
孔府：照壁、正門(東南闕里)、大堂、花廳、內(nèi)宅，西側(cè)為長廊及臨街廂房。
孔園：以大中堂為中心的園林，其間有亭、臺、閣、榭、假山、回廊和池塘。
二、沿革：自南宋建衢州孔氏家廟至建國前夕，一直由孔子世代嫡長孫掌管“衍圣公府”、“博士署”和“奉禮官府”。解放后由政府委托文化部門管理。1999年，市政府直屬機(jī)構(gòu)孔氏南宗家廟管理委員會全權(quán)管理家廟及孔府事宜。
三、歷史上的孔氏南宗家廟及孔氏南宗府：建炎三年(1129年)，孔子四十八世嫡長孫、衍圣公孔端友扈蹕南渡。建炎中，宋高宗下詔“權(quán)以州學(xué)為廟”。至宋理宗寶祐元年(1253年)仲夏，北歸無望，衍圣公孔洙及衢州郡守孫子秀奏請新建家廟，朝廷撥款三十六萬緡，建家廟於城東北菱湖之上，建筑規(guī)模達(dá)二百余楹，規(guī)制與曲阜家廟同。次年仲春落成。宋末元初，家廟毀於兵，遷於城南。但“其制非寶祐之舊”。
至元十九年(1283年)，經(jīng)廷議，認(rèn)定孔氏南宗為孔圣人之宗子，元始祖乃召孔子五十三世嫡長孫、衍圣公孔洙赴京，令其載爵返曲阜奉祀祖廟奉祀；孔洙以廟墓在衢為由，讓爵於曲阜，元始祖贊其“寧為榮而不違道，真圣人后也”，改任其國子監(jiān)祭酒歸守江南廟祀。從此，孔氏大宗失爵。
明弘治十八年(1505年)，衢州知府沈杰向明孝宗朱祐樘上疏，稱：“衢州圣廟，自孔洙讓爵之后，衣冠禮儀，猥同氓庶。今訪得洙六世孫孔彥繩，請授于官，俾主祭事?！贝文?，即正德元年(1506年)，接位的武宗朱厚照秉承先皇旨意，封孔彥繩為翰林院五經(jīng)博士，子孫世襲。這樣，衢州孔氏大宗在失去爵位224年之后，又得到了封號。1935年，國民政府廢去一切封建爵位，分別改任孔子七十三世嫡長孫孔繁豪為和孔子七十七世孫孔德成為南宗、北宗“大成至圣先師奉祀官”。
關(guān)于孔氏南宗，孔德成先生1937年在《孔子世家譜序》中寫道：“……魯之宗親，僅四十三代祖溫如公以藐孤存焉，是為孔氏中興祖。后五傳而至端友公，以從宋南渡家於衢，是謂南宗?！?/p>
自清之后，孔氏南宗家廟再未易址。但順治、康熙、雍正、乾隆、道光、同治、光緒歷朝累有修葺，其中以道光元年的修建規(guī)模最大，主要工程有：移思魯閣於大成殿西北隅、大成殿殿基增高五尺、楹柱易木為石、崇圣祠(即啟圣祠)以下皆拓而新之。整個工程歷時近一年半，耗資萬余金，家廟為之一新。
抗戰(zhàn)時期，日軍二次占領(lǐng)衢州，樂器、禮器被擄略一空。1947年，國民政府曾撥款維修。1960年衢縣縣政府曾撥款維修。1984年，衢州市政府撥款對家廟的主體建筑進(jìn)行維修。1988年，衢州市政府再次撥款對家廟進(jìn)行維修，并復(fù)建圣澤樓和修葺思魯閣。1989年12月12日，浙江省人民政府公布孔氏南宗家廟為省級文保單位。1996年11月20日，國務(wù)院批準(zhǔn)孔氏南宗家廟為全國重點文物保護(hù)單位。2000年5月，衢州市人民政府主持復(fù)建的家廟西軸線與孔府竣工。
四、主要文物遺存：子貢手摹孔子夫婦楷木像、吳道子畫孔子佩劍像、石碑等。