圣水寺位于羅源縣城南郊的蓮花山腰，進深三楹，依山而筑，漸次升高，沿中軸線為山門、天王殿、蓮池、鐘鼓樓、大雄寶殿、法堂，大殿左側(cè)為棲云洞，右側(cè)為門房和香積廚。
首進天王殿，三開間硬山頂，兩邊封火山墻。殿后有“瀉露池”，即蓮池，泉水從石壁涌出，池中栽種荷花，旁有題刻“清池皓月”。“蓮峰月色”為羅源八景之首。
第二進為大雄寶殿，單檐懸山頂，面寬五間，中央三間凹入為前廊。殿前兩側(cè)為鐘鼓樓，殿旁邊有客堂，為朱熹客居傳學處，手書“南石古道”至今仍在，也稱“文公書院”，“書室清幽”亦為羅源八景之一。
客堂邊隔拱形小石橋便是棲云洞。該洞為天然石洞，高約三米，口窄內(nèi)寬，有許多不同朝代的題刻。洞內(nèi)供奉觀音及十八羅漢像，佛臺上有石刻云：“住山比丘正心，謹募檀那壹拾玖位，各人舍錢七貫，制造觀世音菩薩乙尊，并住世羅漢臺拾捌位，安奉供養(yǎng)。歲戊申淳祐捌年玖月拾貳日，造石匠陳曾緣”。洞內(nèi)有“澄心”古井，泉水特別清甜可口；洞頂有平坦巨巖，稱“近日靈臺”，旁邊一巨石，如仙鶴縮頸，稱“眠鶴石”。過數(shù)十步又有石似青龍猛虎，故稱“龍虎巖”。
第三進為法堂，五開間重檐歇山頂。
寺內(nèi)另有僧舍利塔四座，其中有開山祖師諫二頭陀的祖師塔。
圣水寺始建于宋紹圣三年（西元1096年），寺傳承臨濟宗，開山祖師為諫二頭陀，因寺后龍泉巖有人稱“圣水”的清泉，故名圣水寺。
淳祐八年（西元1248年）住持僧正心募錢一百三十余貫，由石匠陳會緣打造觀世音菩薩及十六羅漢象，供于棲云洞中。
慶元年間，朱熹遭偽學之禁，與其徒劉砥、劉礪迎回長樂，在晦翁巖筑室講學。期間應羅源名士黃棆之邀來到羅源為《三黃世家宗傳》家譜作序和題祠堂匾額，住寺側(cè)黃氏私塾“連茹齋”。黃氏后人將“連茹齋”更名為“文公書院”。
明代，全國寺院開始陳列十八羅漢，圣水寺也請人補雕了兩尊雕像。
萬歷間，圣水寺重建大雄寶殿。
三、建筑衍變：
清道光年間，黃氏后人將文公書院舍予圣水寺，改為客堂和禪房。
“文革-”期間，該寺后方鐫有大量宋元明清石刻的龍虎巖被毀。
1980年10月，縣人民政府公布圣水寺為第一批縣級文物保護單位；
1991年3月，圣水寺棲云洞造像公布為福建省重點文物保護單位。
1993年6月18日，石雕羅漢像被盜4尊，此案及時偵破，7月2日從廣東潮州追回。
1994年3月10日，棲云洞的觀音像被盜，至今下落不明。
1994年9月12日，一伙竊賊試圖偷盜棲云洞羅漢石像，在搬下佛臺準備起運時，被寺院人員及時發(fā)現(xiàn)，偷盜未遂。
1995年1月30日，一伙竊賊再次潛入棲云洞偷盜羅漢石像，他們砍下七尊羅漢像的頭部，逃跑時被寺院人員發(fā)現(xiàn)，偷盜未遂。因此次偷盜對羅漢像造成較大破壞，導致第一次申報國家級保護文物未能如愿。
1995年2月27日，漳州龍海市一搶劫團伙闖入寺內(nèi)，將十八尊羅漢像全部劫走。公安部門雖幾經(jīng)周折，將羅漢石像尋回，但大多已傷痕累累，有的破損嚴重。
2005年5月30日，十八羅漢像中的代那婆斯尊者被一伙歹徒盜運到寧德，案發(fā)后，公安機關追回了被盜雕像。因連續(xù)被盜，現(xiàn)棲云洞口已被鎖閉，不對香客和游客開放。
2006年，圣水寺棲云洞造像公布為全國重點文物保護單位。